Образува се от сливането на Бяла и Черна Места, които извират от Рила планина. Реката преминава през централната, най-ниска в релефно отношение част на общината, като тече от север на юг и събира водите на малки и по-големи водни течения, стичащи се по северните и източни склонове на Пирин. В границите на община Банско р. Места приема 5 по-големи десни притока (Ръждавица, Добринишка, Безбожка, Ретиже и Лакинска) и три леви (Златарица, Мътеница и Градишка реки). Оттокът на р. Места е сравнително стабилен. Река Места е трансгранична и се влива в Егейско море, преминавайки през Р. Гърция.